黑船事件后的将近十年里，日本看似平静，其实暗流汹涌，一切风雨都在酝酿着，有革命，有暴动，新选组的登场，成为日本历史上辉煌的一页，尽管他们并不是众望所归，也没有选择正确的历史路线最终全军覆没，但历史抹杀不去他们的存在和他们一度的光辉。 文久三年，新选组的初期成员跟随江户浪士组来到京都并脱离浪士组留在了京都，建立起自己的浪士组，保护将军大人，协助其进行攘夷。 而文久三年，正是新选组关键的一年，一切的变故，都发生在这一年，而新选组的成立和成熟，也是在这一年。