国中三年级的上条凯伊是一位并热衷于网络游戏『数码兽』，好奇心旺盛，性格稍微有点率真，个性极普通的15岁少年。 在一次意外中与多路兽相遇，被亚北追捕途中遇到危险的数码兽，多路兽为了保护凯伊差点失去性命，...

　本作为《数码兽狩猎者》的续作，主角是以米娜为主。 　　在凯伊等人打败奥古杜兽，数码世界和人类世界总算恢复和平，而回到人类世界的大家也再次过上平静的生活。可直到一年以后，新的危机再次出现！但这次的敌人...